Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SNX13Q9Y5W8 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SNX13Q9Y5W8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SNX13Q9Y5W8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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SNX13Q9Y5W8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SNX13Q9Y5W8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNX13Q9Y5W8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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