Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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