Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM35Q9UPQ4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM35Q9UPQ4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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