Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PPP1R26-AS1-201ENST00000455039 643 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AC010834.3-201ENST00000520562 939 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AP002807.1-203ENST00000534517 664 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LHX6Q9UPM6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms