Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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USP18Q9UMW8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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USP18Q9UMW8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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USP18Q9UMW8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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USP18Q9UMW8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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USP18Q9UMW8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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USP18Q9UMW8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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