Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PALD1Q9ULE6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms