Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TUBE1Q9UJT0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms