Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO3A1Q9UIG8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms