Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ABCF2Q9UG63 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms