Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
DKK2Q9UBU2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms