Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPASTQ9UBP0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms