Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
KLHL28Q9NXS3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms