Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MED17Q9NVC6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms