Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms