Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRIQ1Q96JM4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRIQ1Q96JM4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms