Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDK5RAP3Q96JB5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms