Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDXPQ96GD0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms