Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CHFRQ96EP1 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHFRQ96EP1 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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