Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UBXN4Q92575 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBXN4Q92575 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms