Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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