Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
LINC00612Q8N6U2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms