Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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