Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms