Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1388.9 ms