Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP170Q5SW79 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP170Q5SW79 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms