Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TTLL9Q3SXZ7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TTLL9Q3SXZ7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms