Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL24A1Q17RW2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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COL24A1Q17RW2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL24A1Q17RW2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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