Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IMPG1Q17R60 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms