Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FSCN1Q16658 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms