Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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SNAPC1Q16533 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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SNAPC1Q16533 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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SNAPC1Q16533 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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SNAPC1Q16533 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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SNAPC1Q16533 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SNAPC1Q16533 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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