Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
E2F4Q16254 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
E2F4Q16254 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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