Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIK4Q16099 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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