Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ZIC1Q15915 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ZIC1Q15915 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms