Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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