Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ALX1Q15699 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ALX1Q15699 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ALX1Q15699 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ALX1Q15699 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ALX1Q15699 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ALX1Q15699 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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