Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MED1Q15648 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED1Q15648 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED1Q15648 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED1Q15648 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED1Q15648 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED1Q15648 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED1Q15648 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED1Q15648 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED1Q15648 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MED1Q15648 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MED1Q15648 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MED1Q15648 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED1Q15648 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms