Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF11Q15544 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms