Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms