Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PUM3Q15397 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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