Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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UBE3CQ15386 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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UBE3CQ15386 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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UBE3CQ15386 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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UBE3CQ15386 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE3CQ15386 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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