Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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