Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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