Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SSPNQ14714 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SSPNQ14714 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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