Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RUNX3Q13761 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RUNX3Q13761 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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