Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
CAMK2DQ13557 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CAMK2DQ13557 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms