Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD4Q13485 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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