Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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TOP3AQ13472 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TOP3AQ13472 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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