Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SGCGQ13326 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SGCGQ13326 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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