Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP4Q13115 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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