Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTP4A2Q12974 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms